却说在万历末年,德川家康当上征夷大将军，建立幕府,终结了日本的战国时代进入幕府时代,但日本各地的蕃主仍然有不少反对他，德川幕府为了压制这些蕃主，制订了一系列的政策,前面说的闭关锁国只是其中之一,还以“一国一城令”和“参勤交替”等手段来削弱地方诸侯的实力,更颁布“武家诸法度”,对于违反的人施以严刑酷法。
这一系列的措施，引得各地蕃主不满越来越大，卢象升正是注意到了日本国内的矛盾这点，才有了平倭策,他派人联系九州岛上的蕃主。
九州岛历来是东北亚贸易的核心区域，从唐朝至今,中日朝三国客商都汇聚在这里进行交易买卖，上世纪葡萄牙和西班牙人也加入进来,越发繁荣,只是德川幕府执政之后开始执行锁国政策,不许两颗牙来贸易，荷兰人也受到限缩，并规定只允许在长崎交易，贸易量直线下降，等到明军封锁日本海之后，别说贸易，连捕鱼都不能够了。
明军这次军事行动的理由是日本原本是中国的藩属国，历代接受中国皇帝的册封，学习中国文化、技术等，却狼子野心，数次侵略朝鲜，妄图以下犯上，鲸吞中华，如今中国上下一心，要给日本人一些血的教训，因此这次又叫做“惩日战争”。
上次日本海大战失败，幕府派人和谈，李云崖跟朱由检召集大臣们在北京制定了一系列的和谈条件，第一条惩治战犯，把历代侵略朝鲜，骚扰东南沿海的旧账都算上，明确提出来要刨丰臣家的祖坟，如今日本改朝换代，这一条虽然耻辱，但也还能够接受，但后面割九州、北海道两岛，送德川家纲到北京当人质，赔款两亿两白银……这些幕府没办法答应了。
卢象升一面狠怼中央幕府，一面拉拢下面的蕃主，现在日本唯一的通商口岸长崎被德川家族垄断，其他蕃主莫不愤慨，杀妻夺财之恨，不共戴天啊，这些人连生吃了德川家的人的心都有，至于什么全国上下一致对外这种想法，在这个时代的日本还很淡泊，像欧洲一样，下层民众或者武士只忠心于自己的蕃主，对于再往上的幕府可没啥忠心的，事实上，对于明军提出来要把九州岛割让给中国，九州岛的许多蕃主都很乐意的，历史上这里的大名们曾经投向过唐朝。
卢象升给这些蕃主武器装备，还派军官训练他们名下的武士，让他们先在长崎岛上跟幕府的人斗争，并且允诺，只要他们能把幕府的人彻底驱离九州岛，然后集体宣布九州岛归入大明版图，允许他们对外交易，并且有大明皇帝册封他们当将军，允许他们到北京去居住，还可以把子女送到北京去读大学。
现在的北京，人口众多，楼房林立，街道整齐，集市繁荣，拥有最好的学校、医院，以及治安情况，这几年又在修城内有轨电车，在各国传言当中，简直是天堂一般的存在，这些蕃主们怕卢象升反悔，让他签了一份带有朱由检玉印的文书，然后开始露胳膊挽袖子上了。
刚开始都只是小矛盾，幕府发现下方情况不稳，着手往九州岛上增兵施压，他越施压，反抗力量越强，一边是自上向下的施压，一边是自下往上的爆冲，矛盾愈演愈烈，终于在一个风高月黑之夜，这些蕃主们带领他们手下的武士冲进幕府管控的码头、商铺、军营等地，开始血腥地厮杀，他们的装备大部分都很落后，最先进的是打铁丸的燧发枪，还有塞上火药打铁砂的火绳炮，比较牛比的用家传宝刀，大多数人用的是长矛，当然，日本这时候也有从两颗牙手里买来的弗朗机炮，战火在九州岛每一个角落里迅猛燃烧起来，并且有燎原焚天之势。
厮杀进行了一夜，直杀到第二日天明，长崎岛几乎每一寸土地都已经被鲜血染红，随处可见残手断交，还有在蘸了一层血泥浆水的人头。
日本人杀起别国人民时候特别狠，但还不算最狠，他们最狠的是对自己，一个崇尚用刀豁自己肚子还要摆出应用姿势的民族，他用刀豁别人的肚子自然跟吃饭喝水一样简单，当年倭寇乱华时候，他们攻上东南沿海，动则屠村灭族，现在同样屠自己人的村，灭自己人的族，当然，现在国家的概念跟后世不一样，现在每一个蕃主名下的土地是一个国，每个蕃主都是国王，虽然都叫日本，但他们确确实实杀得是“外国人”。
第二天日上三竿，厮杀仍在进行，在初生的太阳下，拿着刀的，拿着茅的，哇哇叫着向前追逐，踩着被鲜血浸透的泥土，双眼里冒出骇人的凶光，一心要把前面的人追上，砍下他的头颅！
德川幕府刚刚统治全国不久，战斗力还相当强悍，而且武器方面也很先进，九州蕃主们死伤惨重，在得到消息以后，幕府立即从本州岛调兵过来，明军却没有像蕃主们想象的那般以战舰切断九州岛跟本州岛之间的联系，消息不但在昨晚第一时间被送回去了，而后幕府派兵过来时也没有受到任何阻拦。
在先前的商讨当中，卢象升不止一次地说过，你们负责消灭九州岛上的幕府势力，我们出动海军配合你——卢象升并没有明确说出来怎么配合，这些蕃主们都想当然地以为明军会彻底封锁九州岛周边海域，当看到一船船幕府的生力军被运上九州岛的时候，这些蕃主们全都傻眼了！
但事情已经进行到这一步，他们已经没有退路，责怪明军不守信用？向幕府投降？全都没有用，只能继续跟幕府派来的“中央军”死磕到底！
而这时候卢象升却实实在在地在履行承诺，出动海军配合这些蕃主，只不过并不是封锁九州岛周边海域，而是分兵去打四国岛。
四国岛不想九州岛这样贸易发达，也不够开放，而且由于靠近中央，从北边可以直接杀上本州岛，过了大阪是京都，幕府的管辖力度更强，卢象升派人联系岛上的蕃主，不但没有成功，反而被蕃主们砍了脑袋，无头尸体吊在竹竿上风干，把人头给卢象升送了回来。
卢象升当时忍耐住，这回趁着九州岛骚乱，幕府抽兵去镇压的时候出兵来打四国岛。
东海舰队临岸列阵，青蛟号调转前面双管舰炮，对准高知城开火，这里是山内家族的封地，当初山内一丰是德川家康的心腹将，对幕府忠心十足，这次砍明军使者的脑袋，风干其尸是他们最先搞出来的。
青蛟号排水量五千多吨，由于炮弹技术升级，火药质量提高，双管舰首炮每个管打出去的炮弹都比夜叉舰单管舰首炮威力更大数倍，两枚一起打出去，那效果不用说了，轰隆一声地动山摇，高知城里暴起大团火光，紧跟着两侧的巡海夜叉也跟着开火，还把各自的舰尾的火龙巢打开，二级火箭万里起云烟已经能够打到十里开外，嗖嗖嗖，一发接一发，连续不断带着长长的火光和刺耳的尖啸落入高知城内，恰似下了一场流星火雨，轰轰爆炸之后开始猛烈燃烧。
高知城内的人被打懵了，等反应过来冲出门以后，发现周围到处都是爆炸，到处都是烈火，日本人本来住在“火材盒”里面，房屋都是木质，纸糊的门窗，遇火即燃，燃即成片，哭喊声，惨叫声，爆炸声……各种声音混合在一起，把整个高知城变成一个沸腾的火锅。
高知蕃主派出三千精锐武士带头杀出来，后面还跟着数不清拿着农具的人，明军这边早有准备，海鲨舰一字排开，将船舷对着岸上，一轮齐射，百余门弦炮同时开火，黑暗里火光乍现，岸上断肢横飞，然后海鲨舰掉头，另一侧弦炮已经准备好，隔舱室里铃声响起，再次齐射……
反复几轮之后，日本兵哭嚎着抱头蹿回，远离海岸线。
袁崇焕问卢象升：“要不要现在派陆战队上岸攻下高知城？”
“不必！”卢象升看着夜幕笼罩下四处火起的高知城，“现在拿下高知城还要派兵驻守，还要保境安民，不如把这些事交给日本幕府去做，况且对于这里咱们不熟悉，黑灯瞎火的，很容易限于被动，让人把杆子上咱们的战士尸体带回来，然后撤，去下一个地方！”
这个晚上，东海舰队兵分两路，绕了四国岛大半圈，所有沿海城市全部受到明军炮火毁灭性的打击，墙塌房碎，畜死人亡。
直到第二天下午，卢象升估计九州岛上打得差不多了，才下令东海舰队彻底切断本州岛跟九州岛之间的海路连接，将一艘艘满载日本足轻的运兵船击沉，没入汪洋大海，然后命令陆战队登上九州岛，开始全盘接收。
等上岸之后，踩着被鲜血浸透的泥土，每抬一次脚都能带上血呼啦的泥浆，明军都惊讶于这场战事的惨烈，周遇吉等人率领陆战队迅速占领主要据点，遇到反抗的，不管是那边的人，一律格杀勿论，到了这个时候，那几个蕃主已经被回过神之后的幕府军揍得满地找牙，好几家蕃主都被幕府军抄家灭族，领地都被毁了，只剩下三家蕃主还有些实力，武士加起来不足两千，而且几乎个个带伤，另有六个蕃主已经成了光杆司令，可以说是惨不忍睹。
他们的拼死抵抗，也给幕府军造成了很大的伤亡，明军登陆时仍在岛上的幕府军总数四千出头，分散成三个部分，被明军分别围住，一一击破，这些由少量武士率领的足轻们，用的武器多是钢刀长矛，哪里是使用□□火炮的明军的对手，到傍晚时，整个九州岛上已经再没有成规模的抵抗力量了。(83中文 .83.)